将军澳屿

将军澳屿无机场，须乘船舶至望安岛转搭飞机（望安航空站）往高雄。

将军澳屿西侧的将军南渔港

将军屿共有两座港口，分别位于岛屿西侧与西北侧。依据渔业署数据，分别为将军南渔港（将军渔港）与将军北渔港（宫渔港），依渔业法分类两者皆为第二类渔港。

将军南渔港，港深3公尺，面积25,000平方公尺，因位于岛屿背风侧且与望安岛潭门港遥遥相对，故为将军屿聚落（将军村）所在地，成为居民主要进出交通门户。设籍将军南港船筏高达百余艘，渔业从业人口众多，早期将军澳更被人称为「船长的故乡」。然本地市场较小且渔业设施不足，渔民需赴马公或七美交易与补给。

将军北渔港因天后宫位于港边，亦有人称「宫港」，或因位于村后，而称「后港」。将军北渔港离聚落较远，故主要交通与渔业皆以南港为主。设籍将军北港之渔船不足十艘。然而将军北港座东朝西，使得该港为台风期间之良好避风港。

乡公所于周一到周五期间安排「将军之星」快艇定时往返望安、将军二岛，航程约4至5分钟。

欲从将军往返马公本岛者，须搭小船至望安再转乘吨数较大的交通船（相对的，从马公本岛欲至将军，则必须到达望安后才能转船至将军）。目前定时往返望安至马公本岛的公营交通船，为澎湖县公共车船管理处经营的350吨级南海之星客、货两用交通船。望安至马公的航程约50分钟。

往返望安岛有渔船兼营的渡轮，如欲搭乘可就近洽询海巡署安检所弟兄，其航程约5至15分钟。

往返望安、将军至马公本岛的大型民营交通船，为198吨的「光正六号」客、货两用交通船， 「光正六号」每天定时于早上约7点（冬令时间约7点30分）从望安出发至将军，再从将军开往马公本岛；下午约2点30分，则从马公本岛南下开往将军，再从将军开往望安，航程约50至60分钟（视气候、船只状况而定）。

夏令时间（冬天之前），每天都有民营小型游艇加入运输往返望安至马公（马公至望安）的旅客行列，航程约40分钟。冬令时间，由于受到澎湖强烈的东北季风影响，一般民营的这些快艇都会停止行驶。

由门仔海峡北望望安（左侧）与将军（右侧）两岛。左图（2006年）可见进行中的望将大桥工程，右图（2021年）中海面建物均已拆除。

将军澳屿环岛滨海公路至2023年前仅余船帆屿北段尚未铺设，然2023年已铺设完成，有完整的环状公路。岛上主要交通工具为机车，虽多数居民住在岛上西南侧港口边，但仍需要机动交通工具。

横跨将军、望安两岛的望将大桥于1995年12月16日依据行政院台一四交44418号函核定列入「澎湖生活圈道路系统建设计划」内运行，台湾省公路局于1997年委托规划设计，由朝国营造厂得标，并于2002年11月10日开工兴建。望将大桥连接澎湖望安乡本岛与将军屿，主桥长440公尺，加上两端引道总长1,753公尺，为悬臂式设计，号称完工后是全台最长的悬臂式大桥。[7]但是碍于技术难度、建材物料上涨等因素，工程进行至38%进度时，包商便弃标停工，再次招标作业后，仍陆续流标7次。

2008年8月15日，交通部做出停工结案的决定，并于9月拆除[8][9][10]，原先建造的引道与桥墩迄2013年已拆除完毕。