碳酸酐酶

碳酸酐酶英语:,EC 4.2.1.1)又称碳酸脱水酶英语:),为催化二氧化碳/水与碳酸间转换的酵素[1],可维系血液中的酸碱平衡与二氧化碳的运输[2]。此类酵素的活性位点通常有一个锌离子,因而属于金属蛋白,在被研究最多的α型碳酸酐酶中,锌离子与三个组氨酸咪唑螯合[3]

碳酸酐酶
人类碳酸酐酶II的结构,中央为一锌离子
识别码
EC编号 4.2.1.1
CAS号 9001-03-0
数据库
IntEnz IntEnz浏览
BRENDA BRENDA入口
ExPASy NiceZyme浏览
KEGG KEGG入口
MetaCyc 代谢路径
PRIAM 概述
PDB RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
基因本体 AmiGO / EGO
碳酸酐酶(真核生物)
鉴定
标志Carb_anhydrase
PfamPF00194旧版
InterProIPR001148
PROSITEPDOC00146
SCOP1can / SUPFAM
膜蛋白数据库333

碳酸酐酶可催化以下反应:

CO2 + H2O H
2
CO
3
H+ + HCO
3
H+ + HCO
3
H
2
CO
3
CO2 + H2O
碳酸酐酶催化的反应机理

种类

碳酸酐酶有α、β、γ、δ与ζ等五大类,不同类别碳酸酐酶的氨基酸串行无显著相似,应是趋同演化的结果。人类的碳酸酐酶属α型。

近年又有η型与ι型的碳酸酐酶被发现。

α型

脊椎动物、部分藻类与细菌具有α型的碳酸酐酶。

哺乳类的碳酸酐酶比较
碳酸酐酶 基因 分子量[4]
(kDa)
分布位置 人类酵素的效率[lower-alpha 1][5] (s−1) 磺酰胺的抑制系数(KI (nM))[5]
细胞 组织[4]
碳酸酐酶ICA129细胞质红血球消化道2.0 × 105250
碳酸酐酶IICA229细胞质广泛分布1.4 × 10612
碳酸酐酶IIICA329细胞质一型骨骼肌(8%可溶性蛋白均为碳酸酐酶III)1.3 × 104240000
碳酸酐酶IVCA435胞外(与糖磷脂酰肌醇相连)消化道、1.1 × 10674
碳酸酐酶VACA5A34.7(估计)线粒体肝脏2.9 × 10563
碳酸酐酶VBCA5B36.4(估计)线粒体广泛分布9.5 × 10554
碳酸酐酶VICA639–42分泌至胞外唾液母乳3.4 × 10511
碳酸酐酶VIICA729细胞质广泛分布9.5 × 1052.5
碳酸酐酶IXCA954, 58细胞膜消化道(数种肿瘤组织亦有分布)3.8 × 10516
碳酸酐酶XIICA1244活性位点位于胞外肾(数种肿瘤组织亦有分布)4.2 × 1055.7
碳酸酐酶XIII[6]CA1329细胞质广泛分布1.5 × 10516
碳酸酐酶XIVCA1454活性位点位于胞外肾、心脏、骨骼肌、3.1 × 10541
CA-XV[7]CA1534–36胞外(与糖磷脂酰肌醇相连)肾(不存在于人类组织)4.7 × 10572

β型

原核生物与植物叶绿体具有β型碳酸酐酶。

γ型

甲烷菌具有γ型碳酸酐酶。

δ型

硅藻具有δ型碳酸酐酶[8]

ɛ型

ɛ型碳酸酐酶见于部分化学自营细菌与蓝菌羧酶体[9],其结构与β型有相似之处,可能为同源,但氨基酸串行已彻底分化[8]

ζ型

ζ型碳酸酐酶仅见于硅藻等部分藻类[10]威氏海链藻(一种硅藻)的ζ型碳酸酐酶可使用(而非锌)为辅酶[11]

η型

η型碳酸酐酶见于疟原虫,过去被认为属于α型,后来发现其金属离子螯合模式等特征与其不同[12]

ι型

ι型碳酸酐酶为截至现在最晚发现的碳酸酐酶,自假微型海链藻(一种硅藻)中发现,也存在其他海生浮游藻类。相较于其他碳酸酐酶使用锌离子催化,ι型碳酸酐酶使用锰离子催化[13]。一些细菌可能也具此类碳酸酐酶[14]

参见

  • 碳酸酐酶抑制物
  • 玻尔效应
  • 碳捕集与封存

注脚

  1. CA XV除外(为小鼠酵素)

参考文献

  1. Badger MR, Price GD. . Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 1994, 45: 369–392. doi:10.1146/annurev.pp.45.060194.002101.
  2. . RCSB: PDB-101. [3 December 2018]. (原始内容存档于2022-11-13).
  3. Krishnamurthy VM, Kaufman GK, Urbach AR, Gitlin I, Gudiksen KL, Weibel DB, Whitesides GM. . Chemical Reviews. March 2008, 108 (3): 946–1051. PMC 2740730可免费查阅. PMID 18335973. doi:10.1021/cr050262p.
  4. Unless else specified: Boron WF. . Elsevier/Saunders. 2005. ISBN 978-1-4160-2328-9. Page 638
  5. Hilvo M, Baranauskiene L, Salzano AM, Scaloni A, Matulis D, Innocenti A, et al. . The Journal of Biological Chemistry. October 2008, 283 (41): 27799–809. PMID 18703501. doi:10.1074/jbc.M800938200可免费查阅.
  6. Lehtonen J, Shen B, Vihinen M, Casini A, Scozzafava A, Supuran CT, et al. . The Journal of Biological Chemistry. January 2004, 279 (4): 2719–27. PMID 14600151. doi:10.1074/jbc.M308984200可免费查阅.
  7. Hilvo M, Tolvanen M, Clark A, Shen B, Shah GN, Waheed A, et al. . The Biochemical Journal. November 2005, 392 (Pt 1): 83–92. PMC 1317667可免费查阅. PMID 16083424. doi:10.1042/BJ20051102.
  8. Sawaya MR, Cannon GC, Heinhorst S, Tanaka S, Williams EB, Yeates TO, Kerfeld CA. . The Journal of Biological Chemistry. March 2006, 281 (11): 7546–55. PMID 16407248. doi:10.1074/jbc.M510464200可免费查阅.
  9. So AK, Espie GS, Williams EB, Shively JM, Heinhorst S, Cannon GC. . Journal of Bacteriology. February 2004, 186 (3): 623–30. PMC 321498可免费查阅. PMID 14729686. doi:10.1128/JB.186.3.623-630.2004.
  10. Alterio V, Langella E, Buonanno M, Esposito D, Nocentini A, Berrino E; et al. . Comput Struct Biotechnol J. 2021, 19: 3427–3436. PMC 8217695可免费查阅. PMID 34194668. doi:10.1016/j.csbj.2021.05.057.
  11. Park H, McGinn PJ, More FM. . Aquatic Microbial Ecology. 19 May 2008, 51: 183–193. doi:10.3354/ame01192可免费查阅.
  12. Del Prete S, Vullo D, Fisher GM, Andrews KT, Poulsen SA, Capasso C, Supuran CT. . Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. September 2014, 24 (18): 4389–4396. PMID 25168745. doi:10.1016/j.bmcl.2014.08.015. hdl:10072/63103可免费查阅.
  13. Jensen EL, Clement R, Kosta A, Maberly SC, Gontero B. . The ISME Journal. August 2019, 13 (8): 2094–2106. PMC 6776030可免费查阅. PMID 31024153. doi:10.1038/s41396-019-0426-8.
  14. Del Prete S, Nocentini A, Supuran CT, Capasso C. . Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry. December 2020, 35 (1): 1060–1068. PMC 7191908可免费查阅. PMID 32314608. doi:10.1080/14756366.2020.1755852.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.