内分泌系统

• 生长激素释放激素（GHRH，Growth Hormone Releasing Hormone）
• 生长激素抑制激素（GHIH，Growth Hormone release-Inhibiting Hormone），又称体抑素（Somatostatin，Growth Hormone release-Inhibiting Hormone）
• 促肾上腺皮质素释放激素（CRH，Corticotropin-Releasing Hormone）
• 促甲状腺激素释放激素（TRH，Thyrotropin-Releasing Hormone）
• 促性腺激素释放激素（GnRF，Gonadotropin-Releasing Factor)
• 泌乳素抑制因子（PIF，尚未证实，Prolactin release-Inhibiting Factor）
• 泌乳素促进因子（PRF，尚未证实，Prolactin Release Factor）
• 多巴胺（DA）

• 脑垂腺前叶(Anterior pituitary)：
  • 生长激素（GH, Growth Hormone）：促进全身细胞及组织生长
  • 促皮质素（ACTH, Adrenocorticotropic Hormone）：促使肾上腺皮质分泌肾上腺皮质激素
  • 甲状腺刺激素（TSH, Thyroid-Stimulating Hormone）：促使甲状腺分泌甲状腺素及三碘甲状腺素
  • 滤泡刺激素（FSH, Follicle-Stimulating Hormone）：在排卵前刺激卵巢中滤泡成长；促使睾丸中的精子生成
  • 黄体成长素（LH, Luteinizing Hormone）：对滤泡最后的成长及排卵非常重要；促使卵巢分泌女性素，睾丸分泌男性素。
  • 泌乳素（PRL, Prolactin）：促进乳房发育及乳汁分泌
• 脑垂腺后叶(Posterior pituitary)：
  • 抗利尿激素（Vasopressin, 也称为血管加压素, ADH, Antidiuretic Hormone）：使肾保留水分，高浓度时能使血管收缩而造成血压上升。
  • 催产素（OT, Oxytocin）：分娩时促进子宫收缩；促使乳腺的肌皮膜细胞收缩，当婴儿吸吮时，乳汁便可流出。

• 褪黑素（Melatonin）

• 皮质
  • 糖皮质激素（Cortisol）：调节糖类、脂肪、蛋白质的代谢
  • 醛固酮（Aldosterone）：作用于肾小管对钠离子的重吸收和排出钾离子
• 髓质
  • 肾上腺素（Epi, Epinephrine）
  • 正肾上腺素（NE, Norepinephrine）

• 甲状腺激素（Thyroid Hormone）
  • 四碘甲状腺素（T4, Thyroxine）、三碘甲状腺素（T3）
• 降钙素（Calcitonin）

• 副甲状腺素（PTH, Parathyroid hormone）

(控制钙、磷的浓度)

• α-细胞：升糖素（Glucagon）
• β-细胞：胰岛素（Insulin）
• δ-细胞：体抑素（Somatostatin）
• PP细胞：胰多肽（PP, Pancreatic polypeptide）

• 动情素（雌性素，Estrogen）
• 黄体酮（助孕酮，Progesterone）

• 睾固酮（Testosterone）

• 动情素（雌性素，Estrogen）
• 黄体素（助孕酮，Progesterone）
• 人类绒毛膜促性腺素（hCG）
• 人体胎盘生乳素（HPL）

• 心房利钠肽（ANP）

内分泌系统和免疫系统之间有频繁的双向交互作用[2]。 皮质醇主要具有免疫抑制效果[3][4]，而多巴胺有免疫调节的功能[5]。另一方面，发炎时产生细胞因子会激化HPA轴，使三个的准位都到达高准位，得以产生负回授[6]。而且细胞因子会使肝脏释放铁调素，最终会导致慢性贫血[7]。

文昌鱼有哈氏凹窝（Hatschek's pit），具有类似脑下腺的结构，能产生类似脊椎动物促性腺激素的物质，并具备原始的激素调控作用。

海鞘有神经腺（Neural gland），是一个囊状构造，位于神经节下方，以纤毛漏斗开口于咽部的背方。含有升压素和类似催产素的物质，但其功能仍有待研究，该腺体与文昌鱼的哈氏凹窝相似。在咽部有一个类似甲状腺的分泌糖蛋白的内分泌腺，该腺体的分泌受血液运送的某物质所控制。

松果眼影响八目鳗的沙床幼虫随昼夜的体色变化、变态及生殖作用。

脑垂腺会分泌黑素胞刺激素、精胺酸血管加压素、生殖促进素。黑素胞刺激素的分泌是由松果眼经由下视丘来控制，可影响体色的变化。八目鳗的脑垂腺具有其它脊椎动物的主要特点，但缺乏足额的激素，控制系统较简单。

没有肾上腺，只有肾上腺组织，分散在身体各部分，有两类细胞。肾间细胞（interrenal cell）在前肾一带大静脉的下方形成若干簇。肾上组织（suprarenal tissue）很发达，分布在心脏和大型血管壁上，含有儿茶酚胺，心脏组织中有肾上腺素和正肾上腺素。

在前肠和肠的交接处，有成簇的兰氏滤泡（follicles of Langerhans），其中只发现一种与哺乳动物分泌胰岛素相似的β细胞。若用烧灼法破坏此组织，会引起血糖增高；若注射葡萄糖则这些细胞内会形成液泡，故这些细胞与糖类代谢有关。