WIV16病毒

WIV16病毒(SL-CoV-WIV6)是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒(SARSr-CoV)的一個病毒株,與造成SARS事件SARS-CoV基因組序列相似度為96%,同使用ACE2受體感染細胞,是迄今發現和SARS-CoV序列相似度最高的蝙蝠病毒,於2016年發表。

WIV16病毒
病毒分類 编辑
(未分级) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
亚属: SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种:
毒株
WIV16病毒 SL-CoV WIV16

發現

WIV16病毒於2013年在雲南昆明中華菊頭蝠糞便樣本中發現並成功分離,其基因組長度為30290nt,與SARS-CoV的序列相似度為為96%,略高於WIV1病毒的95.6%和SHC014病毒的95.4%,是迄今發現和SARS-CoV序列相似度最高的蝙蝠病毒。另外此病毒刺突蛋白胺基酸序列和SARS-CoV的相似度為97%,也高於其他蝙蝠病毒與SARS-CoV的相似度,負責與宿主細胞受體ACE2結合的受體結合結構域(RBD)之胺基酸相似度則為95%,與WIV1相似;但其ORF8和SARS-CoV的相似度則較低,胺基酸序列相似度只有約40%[1]。WIV16病毒和WIV病毒在ORF6和ORF7之間皆有另一開放閱讀框ORFX編碼一輔助蛋白,為這兩個病毒株所特有,可能可以抑制宿主細胞的干擾素β,並刺激NF-κB表現,進而調節宿主的免疫反應[2]

SARS相關蝙蝠病毒中,僅有WIV16病毒與WIV1病毒被成功從樣本中分離,並於體外細胞培養[1][2]

演化樹

截至2021年1月 (2021-01)SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹

16BO133 與SARS-COV相似度82.8 % · 马铁菊头蝠 · 韓國全羅北道 (2016年採集、2019年發表)[3]

Rf1 87.8 % · 马铁菊头蝠 · 中國湖北宜昌 (2004年採集、2005年發表)[4]

BtCoV HKU3 87.9 % · 中华菊头蝠 · 香港、中國廣東 (2004年採集、2005年發表、2010年又發表若干新病毒株)[5]

LYRa11 90.9 % · 中菊头蝠 · 中國雲南保山 (2011年採集、2014年發表)[6]

Rp3 92.6 % · 皮氏菊头蝠 · 中國廣西南寧 (2004年採集、2005年發表)[4]

SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中國雲南禄丰 (2013年採集、2015年發表)[7]

SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中國雲南禄丰 (2013年採集、2015年發表)[7]

SHC014 95.4 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明 (2011年採集、2013年發表)[8]

WIV1 95.6 % · 中华菊头蝠 · 中國雲南昆明 (2012年採集、2013年發表)[8]

WIV16 96.0 % · 中华菊头蝠 · 中國雲南昆明 (2013年採集、2016年發表)[1]

果子貍SARS冠狀病毒 99.8 % · 果子狸 · 中國廣東[5]

SARS-CoV 100 %

SARS-CoV-2 79 %

  蝙蝠病毒
  果子狸病毒
  人類病毒

參考文獻

  1. Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa. Perlman, S. , 编. . Journal of Virology. 2016-03-15, 90 (6). ISSN 0022-538X. PMC 4810638可免费查阅. PMID 26719272. doi:10.1128/JVI.02582-15 (英语).
  2. Zeng LP, Gao YT, Ge XY, Zhang Q, Peng C, Yang XL; et al. . J Virol. 2016, 90 (14): 6573–6582. PMC 4936131可免费查阅. PMID 27170748. doi:10.1128/JVI.03079-15.
  3. Kim, Yongkwan; Son, Kidong; Kim, Young-Sik; Lee, Sook-Young; Jheong, Weonhwa; Oem, Jae-Ku. . Virus Genes. 2019-08, 55 (4). ISSN 0920-8569. PMC 7089380可免费查阅. PMID 31076983. doi:10.1007/s11262-019-01668-w (英语).
  4. Li, Wendong; Shi, Zhengli; Yu, Meng; Ren, Wuze; Smith, Craig; Epstein, Jonathan H.; Wang, Hanzhong; Crameri, Gary; Hu, Zhihong; Zhang, Huajun; Zhang, Jianhong. . Science. 2005-10-28, 310 (5748). ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391 (英语).
  5. Ge, Xing-Yi; Hu, Ben; Shi, Zheng-Li. . Wang, Lin-Fa (编). . Hoboken, NJ: John Wiley & Sons, Inc. 2015-06-26: 127–155. ISBN 978-1-118-81882-4. doi:10.1002/9781118818824.ch5 (英语).
  6. He, Biao; Zhang, Yuzhen; Xu, Lin; Yang, Weihong; Yang, Fanli; Feng, Yun; Xia, Lele; Zhou, Jihua; Zhen, Weibin; Feng, Ye; Guo, Huancheng. Perlman, S. , 编. . Journal of Virology. 2014-06-15, 88 (12). ISSN 0022-538X. PMC 4054348可免费查阅. PMID 24719429. doi:10.1128/JVI.00631-14 (英语).
  7. Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; Song, Zhi-Zhong; Chow, Wang-Ngai; Fan, Rachel Y. Y. Perlman, S. , 编. . Journal of Virology. 2015-10-15, 89 (20). ISSN 0022-538X. PMC 4580176可免费查阅. PMID 26269185. doi:10.1128/JVI.01048-15 (英语).
  8. Ge, Xing-Yi; Li, Jia-Lu; Yang, Xing-Lou; Chmura, Aleksei A.; Zhu, Guangjian; Epstein, Jonathan H.; Mazet, Jonna K.; Hu, Ben; Zhang, Wei; Peng, Cheng; Zhang, Yu-Ji. . Nature. 2013-11, 503 (7477). Bibcode:2013Natur.503..535G. ISSN 0028-0836. PMC 5389864可免费查阅. PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711 (英语).
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