Dicer
Dicer蛋白在人体内由DICER1基因编码,是一种在RNA干扰中扮演着重要角色的RNA酶,属于III型RNA酶。在RNA诱导沉默复合体(RISC)的激活中,Dicer扮演着内核角色。在RNA干扰过程中,Dicer可以将shRNA(小发卡RNA)切割、加工为siRNA(小干扰RNA),将miRNA前体加工为miRNA(微RNA)。
功能

Dicer酶的作用是将shRNA剪切为siRNA或将miRNA前体剪切为miRNA
Dicer酶会将转录而成的、经Drosha酶初步处理的shRNA(小发卡RNA)剪切为siRNA,或将miRNA前体(pre-miRNA)剪切为miRNA。随后,siRNA或miRNA会激活RISC的组装和功能的行使,使RNA干扰得以继续进行[6]。
结构

肠贾第鞭毛虫(Giardia intestinalis)体内的Dicer蛋白。III型RNA酶结构域以绿色标出,PAZ以黄色标出,平台结构域以红色标出,连接不同结构域的螺旋以蓝色标出[7]
人DICER蛋白属于III型RNA酶,具有解旋酶活性以及PAZ结构域(Piwi/Argonaute/Zwille)[8][9]。除了上述结构域外,DICER蛋白还有两个RNaseIII结构域和两个双链RNA结合结构域(DUF283和dsRBD)[10]。
目前的研究表明PAZ结构域可以和shRNA(小发卡RNA)3'端两个凸出的核苷酸结合,III型RNA酶结构域则会在dsRNA周围形成一个假二聚体,启动核酸链的剪切,使shRNA长度逐渐缩短。PAZ结构域和III型RNA酶结构域之间的距离由连接他们的螺旋结构决定,会影响到产生的miRNA/siRNA长度[7]。Dicer的dsRBD结构域会与shRNA结合,不过目前并未解析出具体的结合位点。推测认为dsRBD区可能会与一些调节蛋白(比如人体内的TRBP,果蝇体内的R2D2、Loqs)结合形成复合体,调控RNA酶活性,进而调节终产物的产生[11]。有推测认为解旋酶结构域会参与对长底物的处理[11]
参见
参考
- .
- GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100697 - Ensembl, May 2017
- GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000041415 - Ensembl, May 2017
- . National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- . National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- Bernstein E, Caudy A, Hammond S, Hannon G. . Nature. 2001, 409 (6818): 363–6. PMID 11201747. doi:10.1038/35053110.
- Macrae IJ, Zhou K, Li F, Repic A, Brooks AN, Cande WZ, Adams PD, Doudna JA. . Science. Jan 2006, 311 (5758): 195–8. PMID 16410517. doi:10.1126/science.1121638.
- . (原始内容存档于2019-09-24).
- Matsuda S, Ichigotani Y, Okuda T, Irimura T, Nakatsugawa S, Hamaguchi M. . Biochimica et Biophysica Acta. Jan 2000, 1490 (1-2): 163–9. PMID 10786632. doi:10.1016/S0167-4781(99)00221-3.
- Hammond SM. . FEBS Letters. Oct 2005, 579 (26): 5822–9. PMID 16214139. doi:10.1016/j.febslet.2005.08.079.
- Cenik ES, Fukunaga R, Lu G, Dutcher R, Wang Y, Tanaka Hall TM, Zamore PD. . Molecular Cell. Apr 2011, 42 (2): 172–84. PMC 3115569
. PMID 21419681. doi:10.1016/j.molcel.2011.03.002.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.