肠球菌

肠球菌是一种移生在肠道的革兰氏阳性菌，故名肠球菌。在19世纪末发现，早期归为链球菌属。1930年代中期，依兰斯菲尔德血清分型（Lancefield classification），肠球菌被归类为D群链球菌（Group D Streptococcus），但是与非肠球菌的D群链球菌，如Streptococcus bovis， 在生化特性上有相当大的差异。直到1984年，基因体DNA分析指出肠球菌和链球菌的不同，而将肠球菌独立成为一属。[8]

肠球菌属目前含40个种，临床常见的包括：[9]

• Enterococcus alcedinis Frolková et al. 2013
• 海水肠球菌 Enterococcus aquimarinus Švec et al. 2005
• 驴肠球菌 Enterococcus asini de Vaux et al. 1998
• 鸟肠球菌 Enterococcus avium (ex Nowlan and Deibel 1967) Collins et al. 1984
• Enterococcus bulliens Kadri et al. 2016
• Enterococcus caccae Carvalho et al. 2006
• Enterococcus camelliae Sukontasing et al. 2007
• Enterococcus canintestini Naser et al. 2005
• 犬肠球菌 Enterococcus canis De Graef et al. 2003
• 铅黄肠球菌 Enterococcus casseliflavus (ex Vaughan et al. 1979) Collins et al. 1984[10]
• 盲肠肠球菌 Enterococcus cecorum (Devriese et al. 1983) Williams et al. 1989
• 鸽肠球菌 Enterococcus columbae Devriese et al. 1993
• Enterococcus crotali McLaughlin et al. 2017
• 戴维斯肠球菌 Enterococcus devriesei Švec et al. 2005
• Enterococcus diestrammenae Kim et al. 2013
• 殊异肠球菌 Enterococcus dispar Collins et al. 1991
• Enterococcus dongliensis Li and Gu 2019
• 耐久肠球菌 Enterococcus durans (ex Sherman and Wing 1937) Collins et al. 1984
• Enterococcus eurekensis Cotta et al. 2013
• 粪肠球菌 Enterococcus faecalis (Andrewes and Horder 1906) Schleifer and Kilpper-Bälz 1984
• 屎肠球菌 Enterococcus faecium (Orla-Jensen 1919) Schleifer and Kilpper-Bälz 1984
• 黄色肠球菌 Enterococcus flavescens Pompei et al. 1992，异名
• Enterococcus florum Techo et al. 2019
• 鹑鸡肠球菌 Enterococcus gallinarum (Bridge and Sneath 1982) Collins et al. 1984
• 浅黄肠球菌 Enterococcus gilvus Tyrrell et al. 2002
• 血过氧化物肠球菌 Enterococcus haemoperoxidus Švec et al. 2001
• 赫尔曼肠球菌 Enterococcus hermanniensis Koort et al. 2004
• 小肠肠球菌 Enterococcus hirae Farrow and Collins 1985，海氏肠球菌
• Enterococcus hulanensis Li and Gu 2019
• 意大利肠球菌 Enterococcus italicus Fortina et al. 2004
• Enterococcus lactis Morandi et al. 2012
• Enterococcus lemanii Cotta et al. 2013
• 病臭肠球菌 Enterococcus malodoratus (ex Pette 1955) Collins et al. 1984
• 莫拉维亚肠球菌 Enterococcus moraviensis Švec et al. 2001
• 蒙特肠球菌 Enterococcus mundtii Collins et al. 1986
• Enterococcus nangangensis Li and Gu 2019
• Enterococcus olivae Lucena-Padrós et al. 2014
• 亮黄肠球菌 Enterococcus pallens Tyrrell et al. 2002
• 木戴胜鸟肠球菌 Enterococcus phoeniculicola Law-Brown and Meyers 2003
• 平房肠球菌 Enterococcus pingfangensis Li and Gu 2019
• Enterococcus plantarum Švec et al. 2012
• 猪肠球菌 Enterococcus porcinus Teixeira et al. 2001，异名
• 假鸟肠球菌 Enterococcus pseudoavium Collins et al. 1989
• Enterococcus quebecensis Sistek et al. 2012
• 棉子糖肠球菌 Enterococcus raffinosus Collins et al. 1989
• 鼠肠球菌 Enterococcus ratti Teixeira et al. 2001
• Enterococcus rivorum Niemi et al. 2012
• Enterococcus rotai Sedláček et al. 2013
• 解糖肠球菌 Enterococcus saccharolyticus (Farrow et al. 1985) Rodrigues and Collins 1991
• 少糖肠球菌 Enterococcus saccharominimus Vancanneyt et al. 2004，异名
• Enterococcus saigonensis Harada et al. 2016
• Enterococcus seriolicida Kusuda et al. 1991，异名
• Enterococcus silesiacus Švec et al. 2006
• Enterococcus solitarius Collins et al. 1989，异名
• Enterococcus songbeiensis Li and Gu 2019
• 硫磺肠球菌 Enterococcus sulfureus Martinez-Murcia and Collins 1991
• Enterococcus termitis Švec et al. 2006
• 泰国肠球菌 Enterococcus thailandicus Tanasupawat et al. 2008
• Enterococcus ureasiticus Sistek et al. 2012
• Enterococcus ureilyticus Sedláček et al. 2013
• Enterococcus viikkiensis Rahkila et al. 2011
• 肠绒毛肠球菌 Enterococcus villorum Vancanneyt et al. 2001
• Enterococcus wangshanyuanii Jin et al. 2017[11]
• 香坊肠球菌 Enterococcus xiangfangensis Li et al. 2014，以哈尔滨市香坊的地名命名
• 新疆肠球菌 Enterococcus xinjiangensis Ren et al. 2020

肠球菌在显微镜下典型的排列为成对或短链状，很难与肺炎链球菌区别。肠球菌是兼性厌氧菌，可在有氧和无氧的环境中生长[12]。 虽然肠球菌不能形成孢子，但他们对于生长环境却有很高的耐受性，例如可在下列环境中生长：温度10-45℃、酸碱度pH 4.5-10.0、高盐浓度6.5%NaCl或40%胆汁[13]。最适宜生长温度为35℃，24小时培养可以形成白色菌落。

肠球菌在临床上引起的重要感染包括泌尿道感染、菌血症、心内膜炎、憩室炎和脑膜炎等[13][14] 。敏感性菌株的感染可用氨苄青霉素（ampicillin）、青霉素（penicillin）和万古霉素（vancomycin）治疗[15]。 泌尿道感染则可用呋喃妥因（nitrofurantoin）进行特异性治疗，即使在万古霉素抗药性的情况下[16]。

从医学观点来看，肠球菌的一个重要特性是具有高度的先天抗药性。一些肠球菌对β-内酰胺类抗生素（β-lactam，如青霉素、头孢菌素（cephalosporin）、碳青霉烯（carbapenem）及许多氨基糖苷类抗生素（aminoglycoside）具有抗药性[14]。尤其是过去20多年来，抗万古霉素肠球菌（Vancomycin-Resistant Enterococcus，VRE）在院内感染患者逐渐被检出，尤其是在美国[13]。抗万古霉素肠球菌可用奎奴普丁/达福普丁（quinupristin/dalfopristin）来治疗，约有70％的患者会达到治疗效果[17]，若与去氧羟四环素（doxycycline）合并治疗，可降低抗药性发生的机会。老虎霉素类抗生素（tigecycline）也已证明能用来治疗肠球菌感染[18]。

2008年的一研究分析了欧洲各国（北欧、英国、爱尔兰、法国、中欧、南欧、东欧、荷兰）抗万古霉素肠球菌的发生与流行，并对临床上预防抗万古霉素肠球菌的方式提出建议。此篇文献认为，E. faecium的氨苄青霉素（ampicillin）抗药性可做为抗万古霉素肠球菌风险一个很好的筛检方法；对于分析E. faecium的基因差异（如esp基因、pruK基因）则属次要的方式，因为这些基因学的特征并非在所有抗氨苄青霉素（ampicillin）的E. faecium皆有一致的表现。也就是说，若没有检测出这些基因变异，并不能证明E. faecium菌株不会有扩散或导致疾病的风险[19]。世界卫生组织（WHO）在2017年初将抗万古霉素肠球菌列为「高度威胁」的致病菌[20]。

肠球菌性脑膜炎是神经外科上罕见的并发症。它一般需要通过静脉或鞘内万古霉素来进行治疗，但是治疗效果仍有争议[21]。新的流行病学证据显示，肠球菌亦是慢性细菌性摄护腺炎的主要感染因子，肠球菌会在摄护腺中形成生物膜，使其难以治疗。

除了抗药性，肠球菌也会生成许多毒性因子，毒性因子是作用于人体且会引发许多病灶，甚至造成严重疾病的物质；这些因子皆增加了肠球菌对人体的致病力[22][23][24]。

美国国家院内感染监视系统（NNIS）所建置的国家健康照护安全网络（NHSN）[25]统计发现，肠球菌是院内感染的第二大病原菌[26]，且位居医疗照护相关血液感染比例的第三位[27]，显示肠球菌抗药性所隐藏的致病风险。

目前肠球菌应用于医药级的药用益生菌（pharmaceutical probiotics）主要在欧洲与亚洲部分国家通过上市。市面上以屎肠球菌（E. faecium）作为药用益生菌的安全菌株，主要源自于瑞士原料药厂Cerbios-Pharma SA所研发的Enterococcus faecium SF68®（cernelle 68）菌株。德国、台湾与日本的药厂则多半以粪肠球菌（E. faecalis）研发安全菌株制成药用的益生菌。

目前欧洲食品安全局规定肠球菌E. faecium使用在动物饲料，须通过相关的安全评估，包括了不得检出三种毒性因子和DNA标记：IS16、Esp、hyl-like，以及氨苄青霉素（ampicillin）的最低抑菌浓度（MIC）不得超过2 mg/L，若不符合上述的检验标准，则认定为不安全，此肠球菌不可使用于饲料添加物当中[78]。

水质中的肠球菌标准非常严格，例如在夏威夷州和美国的大部分地区，其海滩周围的水域是每100毫升水中，五个星期的平均值不得超过35菌落形成单位（CFU）的肠球菌，否则该地区可能会发布警告，要求民众远离海滩[79]。2004年，肠球菌更取代了粪大肠菌群和大肠杆菌，成为新的美国联邦公共盐水和淡水海域水质标准[80]。

中华民国的海滩水质也是参考香港及美国，主要以甲类海域之海洋环境品质标准—大肠杆菌群之菌落数在1000 CFU/100mL以下（以下简称「符合甲类」）为判定依据。符合甲类者，再以肠球菌群区分为「优良」或「普通」。当大肠杆菌群 ≦ 1000 CFU/100mL，且肠球菌群 ≦ 50 CFU/100mL，水质标准为「优良」。当大肠杆菌群 ≦1000 CFU/100mL，但肠球菌群＞50 CFU/100mL，水质标准为「普通」。若大肠杆菌群＞1000 CFU/100mL，则「不宜亲水活动」 [81]。

肠球菌通常会在羊血琼脂（sheep's blood agar）上呈现γ-溶血反应[14]。