已测序真核生物基因组列表

已测序真核生物基因组列表包括所有已知的,可以公开获取已组装、注释和发表的细胞核和细胞器基因组序列真核生物;基因组草图不包括在内,只有细胞器序列的物种也不包括。

酿酒酵母是确定其完整基因组序列的第一个真核生物。

1977年,第一次出现DNA测序。1995年,细菌流感嗜血杆菌第一个完成了全基因组序列。1996年,酿酒酵母是第一个发布的真核生物基因组序列。1998年,发布了第一个多细胞真核生物基因组序列,秀丽隐杆线虫

原生生物

以下是最早的5個完成基因組測序的原生生物。更完整的列表,請參閱已測序原生生物基因組列表

植物

以下是最早的5个完成基因组测序的植物,更完整的列表,请参阅已测序植物基因组列表

物种学名类型意义基因组大小预测的基因数完成机构完成年份
Arabidopsis thaliana
生态型:哥伦比亚
拟南芥 模式植物 119 Mb 25,498,[1] 27,400,[2] 31,670 (UniProt) Arabidopsis Genome Initiative[3] 2000[1]
Cyanidioschyzon merolae
Strain:10D
红藻 单细胞真核生物 16.5 Mb 5,331[4] University of Tokyo, Rikkyo University, Saitama University and Kumamoto University 2004[4]
Oryza sativassp
ssp indica
大米 Crop and model organism 420 Mb 32-50,000[5] Beijing Genomics Institute、浙江大学、中国科学院 2002[5]
Ostreococcus tauri 绿藻 单细胞真核生物,基因组较小 12.6 Mb 7,969 (UniProt) Laboratoire Arago 2006[6]
Populus trichocarpa Balsam poplar or Black Cottonwood 固碳模式植物,商业木材and comparison to A. thaliana 550 Mb 45,555[7] The International Poplar Genome Consortium 2006[7]

真菌

以下是最早的5个完成基因组测序的真菌,更完整的列表,请参阅已测序真菌基因组列表

物种意义基因组大小预测基因数目完成机构完成年份
釀酒酵母
Saccharomyces cerevisiae
品系:S288C
酵母菌綱 用于酿造啤酒的酵母;常用的模式生物 12.1 Mb 6,294[8] 大规模国际合作项目[9] 1996[8]
家兔脑胞内原虫
Encephalitozoon cuniculi
微孢子蟲纲 人类病原体 2.9 Mb 1,997[10] GenoscopeUniversité Blaise Pascal 2001[10]
粟酒裂殖酵母
Schizosaccharomyces pombe
品系:972h-
裂殖酵母纲 模式生物 14 Mb 4,824[11] 桑格研究所冷泉港實驗室 2002[11]
粉色麵包黴菌
Neurospora crassa
糞殼菌綱 模式生物 40 Mb 10,082[12] Broad Institute俄勒岡健康與科學大學肯塔基大学堪萨斯大学 2003[12]
黄孢原毛平革菌
Phanerochaete chrysosporium
品系:RP78
傘菌綱 木材腐朽真菌;常用于真菌修復 30Mb 11,777[13] Joint Genome Institute 2004[13]

动物

以下是最早的5个完成基因组测序的动物,更完整的列表,请参阅已测序动物基因组列表

物种类型意义基因组大小预测的基因数目完成机构完成年份
秀麗隱桿線蟲
Caenorhabditis elegans
品系:Bristol N2
线虫动物门 模式动物 100 Mb 19,000[14] 华盛顿大学维康桑格研究所 1998[14]
黑腹果蝇
Drosophila melanogaster
果蝇 模式动物 165 Mb 13,600[15] 塞雷拉基因組公司、加利福尼亞大學柏克萊分校貝勒醫學院、欧洲DGP 2000[15]
甘比亞瘧蚊
Anopheles gambiae
品系:PEST
疟疾载体 278 Mb 13,683[16] 塞雷拉基因組公司法国国家基因测序中心 2002[16]
红鳍东方鲀
Takifugu rubripes
四齒魨科 脊椎动物中的最小基因组 390 Mb 22–29,000[17] 国际河豚基因体协会[18] 2002[19]
智人
Homo sapiens
哺乳动物 3.2 Gb[20] 18,826(CCDS估计) 人类基因组计划委员会和塞雷拉基因組公司 草图:2001[21][22]
完成:2006[23]

参见

参考资料

  1. The Arabidopsis Genome Initiative,. . Nature. December 2000, 408 (6814): 796–815. PMID 11130711. doi:10.1038/35048692.
  2. . [2012-03-08]. (原始内容存档于2020-07-24).
  3. Arabidopsis Genome Initiative 存檔,存档日期2006-02-07.
  4. Matsuzaki M; Misumi O; Shin-I T; et al. . Nature. April 2004, 428 (6983): 653–7. Bibcode:2004Natur.428..653M. PMID 15071595. doi:10.1038/nature02398.
  5. Goff SA; Ricke D; Lan TH; et al. . Science. April 2002, 296 (5565): 92–100. Bibcode:2002Sci...296...92G. PMID 11935018. doi:10.1126/science.1068275.
  6. Derelle E; Ferraz C; Rombauts S; et al. . PNAS. August 2006, 103 (31): 11647–52. Bibcode:2006PNAS..10311647D. PMC 1544224可免费查阅. PMID 16868079. doi:10.1073/pnas.0604795103.
  7. Tuskan GA; Difazio S; Jansson S; et al. . Science. September 2006, 313 (5793): 1596–604. Bibcode:2006Sci...313.1596T. PMID 16973872. doi:10.1126/science.1128691.
  8. Goffeau A, Barrell BG, Bussey H, et al. . Science. October 1996, 274 (5287): 546, 563–7. Bibcode:1996Sci...274..546G. PMID 8849441. doi:10.1126/science.274.5287.546.
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  10. Katinka MD, Duprat S, Cornillot E, et al. . Nature. November 2001, 414 (6862): 450–3. PMID 11719806. doi:10.1038/35106579.
  11. Wood V, Gwilliam R, Rajandream MA, et al. . Nature. February 2002, 415 (6874): 871–80. PMID 11859360. doi:10.1038/nature724.
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  13. Martinez, Diego; Larrondo, Luis F; Putnam, Nik; Gelpke, Maarten D Sollewijn; Huang, Katherine; Chapman, Jarrod; Helfenbein, Kevin G; Ramaiya, Preethi; et al. . Nature Biotechnology. 2004, 22 (6): 695–700. PMID 15122302. doi:10.1038/nbt967.
  14. C. elegans Sequencing Consortium. . Science. December 1998, 282 (5396): 2012–8. Bibcode:1998Sci...282.2012.. PMID 9851916. doi:10.1126/science.282.5396.2012.
  15. Adams MD, Celniker SE, Holt RA, et al. . Science. March 2000, 287 (5461): 2185–95. Bibcode:2000Sci...287.2185.. CiteSeerX 10.1.1.549.8639可免费查阅. PMID 10731132. doi:10.1126/science.287.5461.2185.
  16. Holt RA, Subramanian GM, Halpern A, et al. . Science. October 2002, 298 (5591): 129–49. Bibcode:2002Sci...298..129H. CiteSeerX 10.1.1.149.9058可免费查阅. PMID 12364791. S2CID 4512225. doi:10.1126/science.1076181.H
  17. International Fugu Genome Consortium. Forth Genome Assembly 存檔,存档日期2012-02-05.
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  20. Human Genome Sequencing Consortium, International. . Nature. October 2004, 431 (7011): 931–45. Bibcode:2004Natur.431..931H. PMID 15496913. doi:10.1038/nature03001可免费查阅.
  21. McPherson JD, Marra M, Hillier L, et al. . Nature. February 2001, 409 (6822): 934–41. Bibcode:2001Natur.409..934M. PMID 11237014. doi:10.1038/35057157可免费查阅.
  22. Venter JC, Adams MD, Myers EW, et al. . Science. February 2001, 291 (5507): 1304–51. Bibcode:2001Sci...291.1304V. PMID 11181995. doi:10.1126/science.1058040可免费查阅.
  23. Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, et al. . Nature. May 2006, 441 (7091): 315–21. Bibcode:2006Natur.441..315G. PMID 16710414. doi:10.1038/nature04727可免费查阅.

外部链接

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