已测序真核生物基因组列表
已测序真核生物基因组列表包括所有已知的,可以公开获取已组装、注释和发表的细胞核和细胞器基因组序列的真核生物;基因组草图不包括在内,只有细胞器序列的物种也不包括。
1977年,第一次出现DNA测序。1995年,细菌流感嗜血杆菌第一个完成了全基因组序列。1996年,酿酒酵母是第一个发布的真核生物基因组序列。1998年,发布了第一个多细胞真核生物基因组序列,秀丽隐杆线虫。
原生生物
以下是最早的5個完成基因組測序的原生生物。更完整的列表,請參閱已測序原生生物基因組列表。
植物
以下是最早的5个完成基因组测序的植物,更完整的列表,请参阅已测序植物基因组列表
物种学名 | 类型 | 意义 | 基因组大小 | 预测的基因数 | 完成机构 | 完成年份 |
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Arabidopsis thaliana 生态型:哥伦比亚 |
拟南芥 | 模式植物 | 119 Mb | 25,498,[1] 27,400,[2] 31,670 (UniProt) | Arabidopsis Genome Initiative[3] | 2000[1] |
Cyanidioschyzon merolae Strain:10D |
红藻 | 单细胞真核生物 | 16.5 Mb | 5,331[4] | University of Tokyo, Rikkyo University, Saitama University and Kumamoto University | 2004[4] |
Oryza sativassp ssp indica |
大米 | Crop and model organism | 420 Mb | 32-50,000[5] | Beijing Genomics Institute、浙江大学、中国科学院 | 2002[5] |
Ostreococcus tauri | 绿藻 | 单细胞真核生物,基因组较小 | 12.6 Mb | 7,969 (UniProt) | Laboratoire Arago | 2006[6] |
Populus trichocarpa | Balsam poplar or Black Cottonwood | 固碳模式植物,商业木材and comparison to A. thaliana | 550 Mb | 45,555[7] | The International Poplar Genome Consortium | 2006[7] |
真菌
以下是最早的5个完成基因组测序的真菌,更完整的列表,请参阅已测序真菌基因组列表。
物种 | 纲 | 意义 | 基因组大小 | 预测基因数目 | 完成机构 | 完成年份 |
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釀酒酵母 Saccharomyces cerevisiae 品系:S288C |
酵母菌綱 | 用于酿造啤酒的酵母;常用的模式生物 | 12.1 Mb | 6,294[8] | 大规模国际合作项目[9] | 1996[8] |
家兔脑胞内原虫 Encephalitozoon cuniculi |
微孢子蟲纲 | 人类病原体 | 2.9 Mb | 1,997[10] | Genoscope和Université Blaise Pascal | 2001[10] |
粟酒裂殖酵母 Schizosaccharomyces pombe 品系:972h- |
裂殖酵母纲 | 模式生物 | 14 Mb | 4,824[11] | 桑格研究所和冷泉港實驗室 | 2002[11] |
粉色麵包黴菌 Neurospora crassa |
糞殼菌綱 | 模式生物 | 40 Mb | 10,082[12] | Broad Institute、俄勒岡健康與科學大學、肯塔基大学和堪萨斯大学 | 2003[12] |
黄孢原毛平革菌 Phanerochaete chrysosporium 品系:RP78 |
傘菌綱 | 木材腐朽真菌;常用于真菌修復 | 30Mb | 11,777[13] | Joint Genome Institute | 2004[13] |
动物
以下是最早的5个完成基因组测序的动物,更完整的列表,请参阅已测序动物基因组列表。
物种 | 类型 | 意义 | 基因组大小 | 预测的基因数目 | 完成机构 | 完成年份 |
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秀麗隱桿線蟲 Caenorhabditis elegans 品系:Bristol N2 |
线虫动物门 | 模式动物 | 100 Mb | 19,000[14] | 华盛顿大学和维康桑格研究所 | 1998[14] |
黑腹果蝇 Drosophila melanogaster |
果蝇 | 模式动物 | 165 Mb | 13,600[15] | 塞雷拉基因組公司、加利福尼亞大學柏克萊分校、貝勒醫學院、欧洲DGP | 2000[15] |
甘比亞瘧蚊 Anopheles gambiae 品系:PEST |
蚊子 | 疟疾的载体 | 278 Mb | 13,683[16] | 塞雷拉基因組公司和法国国家基因测序中心 | 2002[16] |
红鳍东方鲀 Takifugu rubripes |
四齒魨科 | 脊椎动物中的最小基因组 | 390 Mb | 22–29,000[17] | 国际河豚基因体协会[18] | 2002[19] |
智人 Homo sapiens |
哺乳动物 | 3.2 Gb[20] | 18,826(CCDS估计) | 人类基因组计划委员会和塞雷拉基因組公司 | 草图:2001[21][22] 完成:2006[23] |
参见
- 基因组
- 人类基因组计划
- 遗传学
- 已测序的生物
- 已测序古菌基因组列表
- 已测序细菌基因组列表
- 已测序质体基因组列表
参考资料
- The Arabidopsis Genome Initiative,. . Nature. December 2000, 408 (6814): 796–815. PMID 11130711. doi:10.1038/35048692.
- . [2012-03-08]. (原始内容存档于2020-07-24).
- Arabidopsis Genome Initiative 的存檔,存档日期2006-02-07.
- Matsuzaki M; Misumi O; Shin-I T; et al. . Nature. April 2004, 428 (6983): 653–7. Bibcode:2004Natur.428..653M. PMID 15071595. doi:10.1038/nature02398.
- Goff SA; Ricke D; Lan TH; et al. . Science. April 2002, 296 (5565): 92–100. Bibcode:2002Sci...296...92G. PMID 11935018. doi:10.1126/science.1068275.
- Derelle E; Ferraz C; Rombauts S; et al. . PNAS. August 2006, 103 (31): 11647–52. Bibcode:2006PNAS..10311647D. PMC 1544224 . PMID 16868079. doi:10.1073/pnas.0604795103.
- Tuskan GA; Difazio S; Jansson S; et al. . Science. September 2006, 313 (5793): 1596–604. Bibcode:2006Sci...313.1596T. PMID 16973872. doi:10.1126/science.1128691.
- Goffeau A, Barrell BG, Bussey H, et al. . Science. October 1996, 274 (5287): 546, 563–7. Bibcode:1996Sci...274..546G. PMID 8849441. doi:10.1126/science.274.5287.546.
- International Collaboration for the Yeast Genome Sequencing 的存檔,存档日期2007-09-27.
- Katinka MD, Duprat S, Cornillot E, et al. . Nature. November 2001, 414 (6862): 450–3. PMID 11719806. doi:10.1038/35106579.
- Wood V, Gwilliam R, Rajandream MA, et al. . Nature. February 2002, 415 (6874): 871–80. PMID 11859360. doi:10.1038/nature724.
- Galagan JE, Calvo SE, Borkovich KA, et al. . Nature. April 2003, 422 (6934): 859–68. Bibcode:2003Natur.422..859G. PMID 12712197. doi:10.1038/nature01554.
- Martinez, Diego; Larrondo, Luis F; Putnam, Nik; Gelpke, Maarten D Sollewijn; Huang, Katherine; Chapman, Jarrod; Helfenbein, Kevin G; Ramaiya, Preethi; et al. . Nature Biotechnology. 2004, 22 (6): 695–700. PMID 15122302. doi:10.1038/nbt967.
- C. elegans Sequencing Consortium. . Science. December 1998, 282 (5396): 2012–8. Bibcode:1998Sci...282.2012.. PMID 9851916. doi:10.1126/science.282.5396.2012.
- Adams MD, Celniker SE, Holt RA, et al. . Science. March 2000, 287 (5461): 2185–95. Bibcode:2000Sci...287.2185.. CiteSeerX 10.1.1.549.8639 . PMID 10731132. doi:10.1126/science.287.5461.2185.
- Holt RA, Subramanian GM, Halpern A, et al. . Science. October 2002, 298 (5591): 129–49. Bibcode:2002Sci...298..129H. CiteSeerX 10.1.1.149.9058 . PMID 12364791. S2CID 4512225. doi:10.1126/science.1076181.H
- International Fugu Genome Consortium. Forth Genome Assembly 的存檔,存档日期2012-02-05.
- International Fugu Genome Consortium 的存檔,存档日期2012-02-05.
- Aparicio S, Chapman J, Stupka E, et al. . Science. August 2002, 297 (5585): 1301–10. Bibcode:2002Sci...297.1301A. PMID 12142439. S2CID 10310355. doi:10.1126/science.1072104.
- Human Genome Sequencing Consortium, International. . Nature. October 2004, 431 (7011): 931–45. Bibcode:2004Natur.431..931H. PMID 15496913. doi:10.1038/nature03001 .
- McPherson JD, Marra M, Hillier L, et al. . Nature. February 2001, 409 (6822): 934–41. Bibcode:2001Natur.409..934M. PMID 11237014. doi:10.1038/35057157 .
- Venter JC, Adams MD, Myers EW, et al. . Science. February 2001, 291 (5507): 1304–51. Bibcode:2001Sci...291.1304V. PMID 11181995. doi:10.1126/science.1058040 .
- Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, et al. . Nature. May 2006, 441 (7091): 315–21. Bibcode:2006Natur.441..315G. PMID 16710414. doi:10.1038/nature04727 .
外部链接
- Diark - a resource for eukaryotic genome research (页面存档备份,存于)
- EMBL-EBL Eukaryotic Genomes
- UCSC Genome Browser (页面存档备份,存于)
- International Sequencing Consortium - Large-scale Sequencing Project Database (页面存档备份,存于)
- Ensembl (页面存档备份,存于) The Ensembl Genome Browser (includes draft and low coverage genomes)
- Fungal Genome Initiative (页面存档备份,存于) (includes draft genomes)
- GOLD:Genomes OnLine Database v 3.0 (页面存档备份,存于)
- SUPERFAMILY comparative genomics database (页面存档备份,存于) Includes genomes of all completely sequenced eukaryotes, and sophisticated datamining plus visualisation tools for analysis
- Rat Genome Database (页面存档备份,存于)
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