DNA错配修复
DNA错配修复(DNA mismatch repair,简称MMR)是生物DNA修复的一种机制,可修补DNA中配对错误的碱基[1][2]。因错配通常发生在新合成的DNA中(可能为碱基发生互变异构所致),进行错配修复时细胞需识别哪一股DNA为新合成者(参见半保留拷贝),并将其碱基切除修复,在许多细菌中旧的DNA一般有被甲基化,新合成的DNA则无,故细胞可以此识别新股,其他细菌与真核生物中的识别机制则有所不同,在真核生物中可能是以DNA刚拷贝后迟滞股(lagging strand)上尚未被连接酶连接的切口识别(且领先股上可能也会有切口)[3]。

大肠杆菌的DNA错配修复过程为MutS蛋白二聚体(MutS2)与新合成DNA上配对错误的碱基结合,接着MutL2会与之结合,MutH则切割错配附近未被甲基化的GATC位点而造成切口,之后MutS2、MutL2与MutH组成的复合体从切口处往错配处方向移动,过程中UvrD解旋酶可将DNA的两股分开,并有外切酶可水解新股DNA(包含错配的碱基)[注 1],直到经过错配的碱基后才停止,最后DNA聚合酶与DNA连接酶可重新合成被移除的DNA串行[4]。真核生物DNA错配修复的过程与原核生物相似,大部分蛋白均与后者的同源,但不同于大肠杆菌的MutS2与MutL2为同源二聚体,真核生物的均为异源二聚体[4],其中MutLα可能具内切酶功能[5]。除上述蛋白外修复过程还有PCNA[6][7]、RPA、RFC、HMGB1与DNA聚合酶δ等蛋白参与[4],有依赖外切酶Exo1的途径,也有使用其他蛋白切调试配DNA的途径[8]。
DNA错配修复的异常与多种疾病相关,Mut蛋白的突变会造成微卫星不稳定,可导致多种癌症,例如遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC)即为MSH2或MLH1等基因突变所致[9],单一基因突变即可致病,两个Mut蛋白的基因皆突变则可能导致透克氏症(错配修复癌症症候群,CMMR-D),常出现早发的结肠癌或脑癌[10]。除Mut蛋白的DNA串行突变外,启动子甲基化等表观遗传修饰与miR-155过度表现等机制也会因降低这些蛋白的表现而抑制DNA错配修复,进而导致癌症[11] [12]。
注脚
- 外切酶种类随MutH切割的相对位置而异,若切割位点在错配碱基的5端,则会使用RecJ或ExoVII等由5端至3端水解的外切酶,反之则使用ExoI或ExoX等由3端至5端水解的外切酶[4]。
参考文献
- Iyer RR, Pluciennik A, Burdett V, Modrich PL. . Chemical Reviews. February 2006, 106 (2): 302–23. PMID 16464007. doi:10.1021/cr0404794.
- Larrea AA, Lujan SA, Kunkel TA. . Cell. May 2010, 141 (4): 730–730.e1. PMID 20478261. doi:10.1016/j.cell.2010.05.002.
- Heller RC, Marians KJ. . Nature Reviews. Molecular Cell Biology. December 2006, 7 (12): 932–43. PMID 17139333. doi:10.1038/nrm2058.
- Li GM. . Cell Res. 2008, 18 (1): 85–98. PMID 18157157. doi:10.1038/cr.2007.115.
- Kadyrov FA, Dzantiev L, Constantin N, Modrich P. . Cell. 2006, 126 (2): 297–308. PMID 16873062. doi:10.1016/j.cell.2006.05.039.
- Pluciennik A, Dzantiev L, Iyer RR, Constantin N, Kadyrov FA, Modrich P. . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. September 2010, 107 (37): 16066–71. PMC 2941292
. PMID 20713735. doi:10.1073/pnas.1010662107.
- Kadyrov FA, Dzantiev L, Constantin N, Modrich P. . Cell. July 2006, 126 (2): 297–308. PMID 16873062. doi:10.1016/j.cell.2006.05.039.
- Goellner EM, Putnam CD, Kolodner RD. . DNA Repair (Amst). 2015, 32: 24–32. PMC 4522362
. PMID 25956862. doi:10.1016/j.dnarep.2015.04.010.
- Ring, Kari L.; Garcia, Christine; Thomas, Martha H.; Modesitt, Susan C. . American Journal of Obstetrics and Gynecology. 2017, 217 (5): 512–521 [2021-05-07]. ISSN 1097-6868. PMID 28411145. doi:10.1016/j.ajog.2017.04.011. (原始内容存档于2021-05-12).
- OMIM 276300
- Truninger K, Menigatti M, Luz J, Russell A, Haider R, Gebbers JO, et al. . Gastroenterology. May 2005, 128 (5): 1160–71. PMID 15887099. doi:10.1053/j.gastro.2005.01.056.
- Valeri N, Gasparini P, Fabbri M, Braconi C, Veronese A, Lovat F, et al. . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. April 2010, 107 (15): 6982–7. PMC 2872463
. PMID 20351277. doi:10.1073/pnas.1002472107.