西洋松露科

塊菌可能的演化過程，子實層由裸露轉為封閉，子囊由圓柱狀漸轉為球狀

塊菌科的絕大多數物種（除Nothojafnea屬以外）為塊菌，子囊果為地下生，不主動釋放孢子，而是透過動物取食而被動釋放。相較於盤菌目其他生長於地上的類群通常具有圓柱狀子囊，且每個子囊中有八枚子囊孢子，本科真菌子囊多為球狀，且其中子囊孢子數目少於八枚[3]。

Gymnohydnotrya屬的類群為塊菌科的姊妹群

1997年，一篇分子種系發生學研究顯示塊菌科與馬鞍菌科的親緣關係接近，且大致可分為分布於北半球的類群（塊菌屬[註 1]與豬塊菌屬）與分布於南半球的類群（Dingleya、Reddellomyces與Labyrinthomyces）兩大演化支[5]。2013年，另一篇研究以rDNA、EF1a 和RPB2[註 2]之基因序列分析本科各類群與部分相近類群的親緣關係[註 3]，結果顯示原本分類地位未定的Gymnohydnotrya與Underwoodia與塊菌科的親緣關係接近，為塊菌科的姊妹群，另外原產於南美洲、傳統上被歸在火絲菌科[6]的杯狀真菌Nothojafnea應屬於塊菌科，為本科唯一一個子囊果生長於地上且非塊菌的類群。此研究所建立的演化樹中，塊菌科可分為兩大演化支，其中一個演化支包含所有塊菌屬的物種（又可細分成11個演化支），另一演化支則包含豬塊菌屬與所有分布於南美洲的類群（Dingleya、Reddellomyces、Labyrinthomyces[註 4]、Nothojafnea）[3]。

塊菌科所有物種均與植物形成外菌根[7]，並無發現腐生營養者。本科現生類群中，分布於北半球者與松科或被子植物（包含單子葉植物與雙子葉植物）形成外菌根，南半球的Dingleya、Reddellomyces、Labyrinthomyces、Nothojafnea與本科的姊妹群Gymnohydnotrya則因當地沒有松科植物，而只與被子植物形成外菌根。2013年的研究主張塊菌科的共祖即是與被子植物形成外菌根，隨後部分塊菌屬與豬塊菌屬的類群再分別轉而與松科樹木共生，而分子演化模型顯示塊菌科的演化支約於距今1.56億年前的侏羅紀晚期出現，與被子植物出現並開始輻射演化的時間吻合。另外塊菌屬約於距今1.42億年前的白堊紀早期與本科其他類群分支，至白堊紀晚期時該屬下的多數演化支均已出現，不過新生代古近紀中期（距今3000萬至5400萬年前）山毛櫸科、樺木科、楊柳科與胡桃科等被子植物樹木的輻射演化，可能促進了與之共生的塊菌屬類群的進一步分化[3]。

蜂窩孢豬塊菌（豬塊菌屬）

黑松露（塊菌屬）

• 豬塊菌屬 Choiromyces
• Dingleya
• Labyrinthomyces
• Nothojafnea：子囊果為杯狀，是本科唯一子囊果生長於地上（非塊菌）的類群[3][8]。
• 奇塊菌屬 Paradoxa：分布於北半球（中國與義大利），僅有三種物種[9]。近年研究認為其為塊菌屬的同物異名[10]。
• Reddellomyces
• 塊菌屬 Tuber

• 松露
• 假松露：有觀點認為不屬於塊菌屬的松露即為假松露[11][12]，也有觀點只把不屬於子囊菌門的松露稱為假松露[13]。
• 塊菌屬物種列表